Index

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__getitem__() (terrainseg.terrainDataset method) (terrainseg.terrainDatasetDynamic method) (terrainseg.utils.trainer.terrainDataset method) (terrainseg.utils.trainer.terrainDatasetDynamic method) __len__() (terrainseg.terrainDataset method) (terrainseg.terrainDatasetDynamic method) (terrainseg.utils.trainer.terrainDataset method) (terrainseg.utils.trainer.terrainDatasetDynamic method)

_chip_bbox_from_point() (in module terrainseg.utils.dynamicchips) _chip_window() (in module terrainseg.utils.chips) _ensure_dirs() (in module terrainseg.utils.chips) _make_act() (in module terrainseg.models.customunet) _valid_gn_groups() (in module terrainseg.models.convnextunet) _window_from_bounds_aligned() (in module terrainseg.utils.dynamicchips) _window_transform() (in module terrainseg.utils.chips)

A

a1 (terrainseg.models.customunet.AsppBlk attribute) (terrainseg.models.customunet.AsppBlkR attribute) a2 (terrainseg.models.customunet.AsppBlk attribute) (terrainseg.models.customunet.AsppBlkR attribute) a3 (terrainseg.models.customunet.AsppBlk attribute) (terrainseg.models.customunet.AsppBlkR attribute) a4 (terrainseg.models.customunet.AsppBlk attribute) (terrainseg.models.customunet.AsppBlkR attribute) a5 (terrainseg.models.customunet.AsppBlk attribute) (terrainseg.models.customunet.AsppBlkR attribute)

act (terrainseg.models.convnextunet.ConvNeXtBlock attribute) align_corners (terrainseg.models.customunet.UpSamp attribute) (terrainseg.models.customunet.UpSampConv attribute) aspp (terrainseg.models.customunet.AsppComp attribute) AsppBlk (class in terrainseg.models.customunet) AsppBlkR (class in terrainseg.models.customunet) AsppComp (class in terrainseg.models.customunet) AttentionGate (class in terrainseg.models.convnextunet) attn (terrainseg.models.convnextunet.UpStageAttnRes attribute) AttnBlk (class in terrainseg.models.customunet) avg_pool (terrainseg.models.customunet.SEModule attribute)

B

background_value (terrainseg.terrainDatasetDynamic attribute) (terrainseg.utils.trainer.terrainDatasetDynamic attribute) bias (terrainseg.models.convnextunet.LayerNorm2d attribute) block (terrainseg.models.customunet.DoubleConvBlk attribute) blocks (terrainseg.models.convnextunet.DownStage attribute) botChn (terrainseg.defineUNet attribute) (terrainseg.models.unet.defineUNet attribute)

Bottleneck (class in terrainseg.models.customunet) bottleneck (terrainseg.defineCNXTUNet attribute), [1] (terrainseg.defineUNet attribute) (terrainseg.models.convnextunet.defineCNXTUNet attribute), [1] (terrainseg.models.unet.defineUNet attribute) BottleneckR (class in terrainseg.models.customunet) btnk (terrainseg.models.customunet.Bottleneck attribute) (terrainseg.models.customunet.BottleneckR attribute)

C

c4 (terrainseg.defineCUNet attribute) (terrainseg.models.customunet.defineCUNet attribute) cell_size (terrainseg.lspModule attribute) (terrainseg.terrainDatasetDynamic attribute) (terrainseg.utils.lsps.lspModule attribute) (terrainseg.utils.trainer.terrainDatasetDynamic attribute) (terrainseg.utils.trainer.terrainSegModel attribute) cellSize (terrainseg.lspCalc attribute) (terrainseg.utils.lsps.lspCalc attribute) checkDynamicChips() (in module terrainseg) (in module terrainseg.utils.dynamicchips) chip_size (terrainseg.terrainDatasetDynamic attribute) (terrainseg.utils.trainer.terrainDatasetDynamic attribute)

classifier (terrainseg.defineUNet attribute) (terrainseg.models.customunet.ClassifierBlk attribute) (terrainseg.models.unet.defineUNet attribute) ClassifierBlk (class in terrainseg.models.customunet) conv (terrainseg.models.convnextunet.UpStageAttnRes attribute) (terrainseg.models.customunet.FeatReduce attribute) (terrainseg.models.customunet.SimpleConvBlk attribute) conv1_1 (terrainseg.models.customunet.AsppBlk attribute) (terrainseg.models.customunet.AsppBlkR attribute) conv1x1 (terrainseg.models.customunet.UpSampConv attribute) ConvNeXtBlock (class in terrainseg.models.convnextunet) crop_tensor() (in module terrainseg.utils.trainer)

D

d1 (terrainseg.defineCUNet attribute) (terrainseg.models.customunet.defineCUNet attribute) d2 (terrainseg.defineCUNet attribute) (terrainseg.models.customunet.defineCUNet attribute) d3 (terrainseg.defineCUNet attribute) (terrainseg.models.customunet.defineCUNet attribute) d4 (terrainseg.defineCUNet attribute) (terrainseg.models.customunet.defineCUNet attribute) decoder1 (terrainseg.defineUNet attribute) (terrainseg.models.unet.defineUNet attribute) decoder1up (terrainseg.defineUNet attribute) (terrainseg.models.unet.defineUNet attribute) decoder2 (terrainseg.defineUNet attribute) (terrainseg.models.unet.defineUNet attribute) decoder2up (terrainseg.defineUNet attribute) (terrainseg.models.unet.defineUNet attribute) decoder3 (terrainseg.defineUNet attribute) (terrainseg.models.unet.defineUNet attribute) decoder3up (terrainseg.defineUNet attribute) (terrainseg.models.unet.defineUNet attribute) decoder4 (terrainseg.defineUNet attribute) (terrainseg.models.unet.defineUNet attribute) decoder4up (terrainseg.defineUNet attribute) (terrainseg.models.unet.defineUNet attribute) decoderChn (terrainseg.defineUNet attribute) (terrainseg.models.unet.defineUNet attribute) defineCNXTUNet (class in terrainseg) (class in terrainseg.models.convnextunet) defineCUNet (class in terrainseg) (class in terrainseg.models.customunet) defineUNet (class in terrainseg) (class in terrainseg.models.unet) delta (terrainseg.unifiedFocalLoss attribute) (terrainseg.utils.trainer.unifiedFocalLoss attribute) device (terrainseg.unifiedFocalLoss attribute) (terrainseg.utils.trainer.unifiedFocalLoss attribute)

df (terrainseg.terrainDataset attribute) (terrainseg.terrainDatasetDynamic attribute) (terrainseg.utils.trainer.terrainDataset attribute) (terrainseg.utils.trainer.terrainDatasetDynamic attribute) do_bn_act (terrainseg.models.customunet.FeatReduce attribute) do_gp (terrainseg.lspModule attribute) (terrainseg.utils.lsps.lspModule attribute) (terrainseg.utils.trainer.terrainSegModel attribute) doTPIHS (terrainseg.lspCalc attribute) (terrainseg.utils.lsps.lspCalc attribute) double_conv() (in module terrainseg.models.unet) DoubleConvBlk (class in terrainseg.models.customunet) DoubleConvBlkR (class in terrainseg.models.customunet) DoubleConvGN (class in terrainseg.models.convnextunet) down (terrainseg.models.convnextunet.DownStage attribute) down1 (terrainseg.defineCNXTUNet attribute) (terrainseg.models.convnextunet.defineCNXTUNet attribute) down2 (terrainseg.defineCNXTUNet attribute) (terrainseg.models.convnextunet.defineCNXTUNet attribute) down3 (terrainseg.defineCNXTUNet attribute) (terrainseg.models.convnextunet.defineCNXTUNet attribute) down4 (terrainseg.defineCNXTUNet attribute) (terrainseg.models.convnextunet.defineCNXTUNet attribute) DownStage (class in terrainseg.models.convnextunet) drop_path (terrainseg.models.convnextunet.ConvNeXtBlock attribute) dUp1 (terrainseg.defineCUNet attribute) (terrainseg.models.customunet.defineCUNet attribute) dUp2 (terrainseg.defineCUNet attribute) (terrainseg.models.customunet.defineCUNet attribute) dUp3 (terrainseg.defineCUNet attribute) (terrainseg.models.customunet.defineCUNet attribute) dUp4 (terrainseg.defineCUNet attribute) (terrainseg.models.customunet.defineCUNet attribute) dwconv (terrainseg.models.convnextunet.ConvNeXtBlock attribute)

E

e1 (terrainseg.defineCUNet attribute) (terrainseg.models.customunet.defineCUNet attribute) e2 (terrainseg.defineCUNet attribute) (terrainseg.models.customunet.defineCUNet attribute) e3 (terrainseg.defineCUNet attribute) (terrainseg.models.customunet.defineCUNet attribute) e4 (terrainseg.defineCUNet attribute) (terrainseg.models.customunet.defineCUNet attribute) encoder1 (terrainseg.defineUNet attribute) (terrainseg.models.unet.defineUNet attribute)

encoder2 (terrainseg.defineUNet attribute) (terrainseg.models.unet.defineUNet attribute) encoder3 (terrainseg.defineUNet attribute) (terrainseg.models.unet.defineUNet attribute) encoder4 (terrainseg.defineUNet attribute) (terrainseg.models.unet.defineUNet attribute) encoderChn (terrainseg.defineUNet attribute) (terrainseg.models.unet.defineUNet attribute) eps (terrainseg.models.convnextunet.LayerNorm2d attribute)

F

f (terrainseg.models.convnextunet.ResidualDoubleConvGN attribute) FeatReduce (class in terrainseg.models.customunet) final_act (terrainseg.models.customunet.AsppBlkR attribute) (terrainseg.models.customunet.DoubleConvBlkR attribute) forward() (terrainseg.defineCNXTUNet method) (terrainseg.defineCUNet method) (terrainseg.defineUNet method) (terrainseg.gaussPyramids method) (terrainseg.lspCalc method) (terrainseg.lspModule method) (terrainseg.models.convnextunet.AttentionGate method) (terrainseg.models.convnextunet.ConvNeXtBlock method) (terrainseg.models.convnextunet.defineCNXTUNet method) (terrainseg.models.convnextunet.DoubleConvGN method) (terrainseg.models.convnextunet.DownStage method) (terrainseg.models.convnextunet.LayerNorm2d method) (terrainseg.models.convnextunet.ResidualDoubleConvGN method) (terrainseg.models.convnextunet.SkipProjection method) (terrainseg.models.convnextunet.Upsampler method) (terrainseg.models.convnextunet.UpStageAttnRes method) (terrainseg.models.customunet.AsppBlk method) (terrainseg.models.customunet.AsppBlkR method) (terrainseg.models.customunet.AsppComp method) (terrainseg.models.customunet.AttnBlk method) (terrainseg.models.customunet.Bottleneck method) (terrainseg.models.customunet.BottleneckR method) (terrainseg.models.customunet.ClassifierBlk method) (terrainseg.models.customunet.defineCUNet method) (terrainseg.models.customunet.DoubleConvBlk method) (terrainseg.models.customunet.DoubleConvBlkR method) (terrainseg.models.customunet.FeatReduce method) (terrainseg.models.customunet.GlobalAvgPool2d method) (terrainseg.models.customunet.InterpUp method) (terrainseg.models.customunet.SEModule method) (terrainseg.models.customunet.SimpleConvBlk method) (terrainseg.models.customunet.UpConvBlk method) (terrainseg.models.customunet.UpSamp method) (terrainseg.models.customunet.UpSampConv method) (terrainseg.models.unet.defineUNet method) (terrainseg.unifiedFocalLoss method) (terrainseg.utils.lsps.gaussPyramids method) (terrainseg.utils.lsps.lspCalc method) (terrainseg.utils.lsps.lspModule method) (terrainseg.utils.trainer.terrainSegModel method) (terrainseg.utils.trainer.unifiedFocalLoss method)

G

gamma (terrainseg.unifiedFocalLoss attribute) (terrainseg.utils.trainer.unifiedFocalLoss attribute) gaussPyramid (terrainseg.lspModule attribute) (terrainseg.utils.lsps.lspModule attribute)

gaussPyramids (class in terrainseg) (class in terrainseg.utils.lsps) GlobalAvgPool2d (class in terrainseg.models.customunet)

H

head (terrainseg.defineCNXTUNet attribute), [1] (terrainseg.models.convnextunet.defineCNXTUNet attribute), [1] hs_radius (terrainseg.lspModule attribute) (terrainseg.utils.lsps.lspModule attribute) (terrainseg.utils.trainer.terrainSegModel attribute)

hsRadius (terrainseg.lspCalc attribute) (terrainseg.utils.lsps.lspCalc attribute)

I

in_channels (terrainseg.lspModule attribute) (terrainseg.utils.lsps.lspModule attribute) inChn (terrainseg.defineUNet attribute) (terrainseg.gaussPyramids attribute) (terrainseg.models.unet.defineUNet attribute) (terrainseg.utils.lsps.gaussPyramids attribute) (terrainseg.utils.trainer.terrainSegModel attribute)

inner_radius (terrainseg.lspModule attribute) (terrainseg.utils.lsps.lspModule attribute) (terrainseg.utils.trainer.terrainSegModel attribute) innerRadius (terrainseg.lspCalc attribute) (terrainseg.utils.lsps.lspCalc attribute) interp_mode (terrainseg.models.convnextunet.Upsampler attribute) InterpUp (class in terrainseg.models.customunet)

L

lambda_ (terrainseg.unifiedFocalLoss attribute) (terrainseg.utils.trainer.unifiedFocalLoss attribute) LayerNorm2d (class in terrainseg.models.convnextunet) lspCalc (class in terrainseg) (class in terrainseg.utils.lsps) lspGP (terrainseg.lspModule attribute) (terrainseg.utils.lsps.lspModule attribute)

lspM (terrainseg.utils.trainer.terrainSegModel attribute) lspModule (class in terrainseg) (class in terrainseg.utils.lsps) lspOrig (terrainseg.lspModule attribute) (terrainseg.utils.lsps.lspModule attribute)

M

makeChips() (in module terrainseg) (in module terrainseg.utils.chips) makeChipsDF() (in module terrainseg) (in module terrainseg.utils.chips) makeChipsMulticlass() (in module terrainseg) (in module terrainseg.utils.chips) makeDynamicChip() (in module terrainseg.utils.dynamicchips) makeDynamicChipsGDF() (in module terrainseg) (in module terrainseg.utils.dynamicchips) makeMasks() (in module terrainseg) (in module terrainseg.utils.chips) mode (terrainseg.models.convnextunet.Upsampler attribute) (terrainseg.models.customunet.UpSamp attribute) (terrainseg.models.customunet.UpSampConv attribute)

ModeMask (in module terrainseg.utils.chips) module terrainseg terrainseg.models terrainseg.models.convnextunet terrainseg.models.customunet terrainseg.models.unet terrainseg.utils terrainseg.utils.checks terrainseg.utils.chips terrainseg.utils.dynamicchips terrainseg.utils.lsps terrainseg.utils.spatialpredict terrainseg.utils.trainer

N

nCls (terrainseg.defineUNet attribute) (terrainseg.models.unet.defineUNet attribute) (terrainseg.unifiedFocalLoss attribute) (terrainseg.utils.trainer.unifiedFocalLoss attribute)

net (terrainseg.models.convnextunet.DoubleConvGN attribute) (terrainseg.models.convnextunet.SkipProjection attribute) norm (terrainseg.models.convnextunet.ConvNeXtBlock attribute)

O

outer_radius (terrainseg.lspModule attribute) (terrainseg.utils.lsps.lspModule attribute) (terrainseg.utils.trainer.terrainSegModel attribute)

outerRadius (terrainseg.lspCalc attribute) (terrainseg.utils.lsps.lspCalc attribute)

P

pd_like_class_table() (in module terrainseg.utils.checks) phi_g (terrainseg.models.convnextunet.AttentionGate attribute) psi (terrainseg.models.convnextunet.AttentionGate attribute) (terrainseg.models.customunet.AttnBlk attribute)

pwconv1 (terrainseg.models.convnextunet.ConvNeXtBlock attribute) pwconv2 (terrainseg.models.convnextunet.ConvNeXtBlock attribute)

R

res (terrainseg.models.customunet.DoubleConvBlkR attribute)

ResidualDoubleConvGN (class in terrainseg.models.convnextunet)

S

s_factor (terrainseg.models.customunet.InterpUp attribute) saveDynamicChips() (in module terrainseg.utils.dynamicchips) scale_factor (terrainseg.models.customunet.UpSamp attribute) (terrainseg.models.customunet.UpSampConv attribute) se (terrainseg.models.customunet.SEModule attribute) SEModule (class in terrainseg.models.customunet) SimpleConvBlk (class in terrainseg.models.customunet) skip (terrainseg.models.customunet.AsppBlkR attribute) (terrainseg.models.customunet.DoubleConvBlkR attribute) SkipProjection (class in terrainseg.models.convnextunet) smooth (terrainseg.unifiedFocalLoss attribute) (terrainseg.utils.trainer.unifiedFocalLoss attribute)

smooth_radius (terrainseg.lspModule attribute) (terrainseg.utils.lsps.lspModule attribute) (terrainseg.utils.trainer.terrainSegModel attribute) smoothRadius (terrainseg.lspCalc attribute) (terrainseg.utils.lsps.lspCalc attribute) spat_dim (terrainseg.lspModule attribute) (terrainseg.utils.lsps.lspModule attribute) (terrainseg.utils.trainer.terrainSegModel attribute) spatDims (terrainseg.gaussPyramids attribute) (terrainseg.utils.lsps.gaussPyramids attribute) stem (terrainseg.defineCNXTUNet attribute), [1] (terrainseg.models.convnextunet.defineCNXTUNet attribute), [1]

T

t_crop (terrainseg.utils.trainer.terrainSegModel attribute) terrainDataset (class in terrainseg) (class in terrainseg.utils.trainer) terrainDatasetDynamic (class in terrainseg) (class in terrainseg.utils.trainer) terrainPredict() (in module terrainseg) (in module terrainseg.utils.spatialpredict) terrainseg module terrainseg.models module terrainseg.models.convnextunet module terrainseg.models.customunet module terrainseg.models.unet module terrainseg.utils module

terrainseg.utils.checks module terrainseg.utils.chips module terrainseg.utils.dynamicchips module terrainseg.utils.lsps module terrainseg.utils.spatialpredict module terrainseg.utils.trainer module terrainSegModel (class in terrainseg.utils.trainer) terrainTrainer() (in module terrainseg.utils.trainer) theta_x (terrainseg.models.convnextunet.AttentionGate attribute) transform (terrainseg.terrainDataset attribute) (terrainseg.utils.trainer.terrainDataset attribute) transforms (terrainseg.terrainDatasetDynamic attribute) (terrainseg.utils.trainer.terrainDatasetDynamic attribute) trnM (terrainseg.utils.trainer.terrainSegModel attribute)

U

unifiedFocalLoss (class in terrainseg) (class in terrainseg.utils.trainer) up (terrainseg.models.convnextunet.UpStageAttnRes attribute) (terrainseg.models.customunet.UpConvBlk attribute) up1 (terrainseg.defineCNXTUNet attribute) (terrainseg.models.convnextunet.defineCNXTUNet attribute) up2 (terrainseg.defineCNXTUNet attribute) (terrainseg.models.convnextunet.defineCNXTUNet attribute) up3 (terrainseg.defineCNXTUNet attribute) (terrainseg.models.convnextunet.defineCNXTUNet attribute) up4 (terrainseg.defineCNXTUNet attribute) (terrainseg.models.convnextunet.defineCNXTUNet attribute) up_conv() (in module terrainseg.models.unet) UpConvBlk (class in terrainseg.models.customunet)

UpSamp (class in terrainseg.models.customunet) UpSampConv (class in terrainseg.models.customunet) Upsampler (class in terrainseg.models.convnextunet) UpStageAttnRes (class in terrainseg.models.convnextunet) use_aspp (terrainseg.defineCUNet attribute) (terrainseg.models.customunet.defineCUNet attribute) use_attn (terrainseg.defineCUNet attribute) (terrainseg.models.customunet.defineCUNet attribute) use_res (terrainseg.defineCUNet attribute) (terrainseg.models.customunet.defineCUNet attribute) use_se (terrainseg.defineCUNet attribute) (terrainseg.models.customunet.defineCUNet attribute) useLogCosH (terrainseg.unifiedFocalLoss attribute) (terrainseg.utils.trainer.unifiedFocalLoss attribute)

V

viewBatch() (in module terrainseg) (in module terrainseg.utils.checks)

W

W_gate (terrainseg.models.customunet.AttnBlk attribute)

W_x (terrainseg.models.customunet.AttnBlk attribute) weight (terrainseg.models.convnextunet.LayerNorm2d attribute)

Z

zeroStart (terrainseg.unifiedFocalLoss attribute) (terrainseg.utils.trainer.unifiedFocalLoss attribute)